水利监理工程师的注册主要在中国水利工程协会官网或者水利部政务服务平台进行。具体注册流程如下：中国水利工程协会官网访问中国水利工程协会官网（http://www.cweun.com.cn/）。按照网站提示完成注册流程，准备好相关材料。水利部政务服务平台登录水利部政务服务平台（https://link.